GenBank數(shù)據(jù)庫功能為：

一、提交獲取的基因序列；

二、查找已知基因的序列生物學(xué)特性信息，例如編碼區(qū)，科學(xué)命名等。

那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？

genBank數(shù)據(jù)庫起源

GenBank數(shù)據(jù)庫是1982年由美國國立生物技術(shù)信息中心（NCBI）建立并維護(hù)的綜合性序列數(shù)據(jù)庫。大約每2個(gè)月會更新一次版本，截止到2004年9月最新的版本是Release143，共有37，343，937 條序列紀(jì)錄，大約包含了來源于約140，000個(gè)物種的41，808，045，653個(gè)堿基。所有數(shù)據(jù)記錄被劃分在若干個(gè)文件里，如細(xì)菌類、病毒類、靈長類、嚙齒類，以及 EST 數(shù)據(jù)、基因組測序數(shù)據(jù)、大規(guī)模基因組序列數(shù)據(jù)等 16 類，其中 EST 數(shù)據(jù)等又被各自分成若干個(gè)文件。它的數(shù)據(jù)直接來源于測序工作者提交的序列;由測序中心提交的大量EST序列和其它測序數(shù)據(jù);以及與其它數(shù)據(jù)機(jī)構(gòu)協(xié)作交換數(shù)據(jù)。Genbank每天都會與歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室（EMBL）的數(shù)據(jù)庫，和日本的DNA數(shù)據(jù)庫（DDBJ）交換數(shù)據(jù)，使這三個(gè)數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)同步。

GenBank數(shù)據(jù)庫功能

實(shí)驗(yàn)工作人員使用GenBank的功能之一就是通過GenBank提供的2個(gè)軟件工具把本實(shí)驗(yàn)的研究序列提交到數(shù)據(jù)庫中從而獲取序列號，這樣發(fā)表文獻(xiàn)時(shí)便于引用，成為學(xué)術(shù)界承認(rèn)的實(shí)驗(yàn)工作樣品，從而其他人可以重復(fù)實(shí)驗(yàn)，現(xiàn)在權(quán)威的刊物都需要提供序列的存儲編號。這2個(gè)工具的地址在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/

BankIt是一系列表單，包括聯(lián)絡(luò)信息、發(fā)布要求、引用參考信息、序列來源信息、以及序列本身的信息等。用戶提交序列后，會從電子郵件收到自動(dòng)生成的數(shù)據(jù)條目，GenBank的新序列編號，以及完成注釋后的完整的數(shù)據(jù)記錄。用戶還可以在BankIt頁面下修改已經(jīng)發(fā)布序列的信息。BankIt適合于獨(dú)立測序工作者提交少量序列，而不適合大量序列的提交，也不適合提交很長的序列，EST序列和GSS序列也不用BankIt提交。BankIt使用說明和對序列的要求可詳見其主頁面。

大量的序列提交可以由Sequin程序完成。Sequin程序能方便的編輯和處理復(fù)雜注釋，并包含一系列內(nèi)建的檢查函數(shù)來提高序列的質(zhì)量保證。它還被設(shè)計(jì)用于提交來自系統(tǒng)進(jìn)化、種群和突變研究的序列，可以加入比對的數(shù)據(jù)。Sequin除了用于編輯和修改序列數(shù)據(jù)記錄，還可以用于序列的分析，任何以FASTA或ASN.1格式序列為輸入數(shù)據(jù)的序列分析程序都可以整合到Sequin程序下。在不同操作系統(tǒng)下運(yùn)行的Sequin程序都可以在ftp://ncbi.nlm.nih.gov/sequin/ 下找到，Sequin的使用說明可詳見其網(wǎng)頁。

使用GenBank的重要的功能之二是按照實(shí)驗(yàn)的要求查詢序列信息以及相關(guān)的研究文獻(xiàn)。通過GenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)記錄包含了找到序列的簡要描述，它的科學(xué)命名，物種分類名稱，參考文獻(xiàn)，序列特征表，以及序列本身。序列特征表里包含對序列生物學(xué)特征注釋如：編碼區(qū)、轉(zhuǎn)錄單元、重復(fù)區(qū)域、突變位點(diǎn)或修飾位點(diǎn)等。

GenBank數(shù)據(jù)庫常見問題與解答：

1、什么是Genebank ID?從什么網(wǎng)址檢索基因庫?

Genebank ID 就是genbank中基因的序列編號，你可以在www.NCBI.NLM.NIH.GOV中檢索你感興趣的基因，你可以了解相關(guān)的基因序列以及簡單的功能描述，你也可以根據(jù)基因名稱查找相關(guān)的文獻(xiàn)。

2、Gene cluster ID 是什么？

Gene cluster ID 是指特定基因的編號，由于每一個(gè)基因在GENBANK中可能會登記多個(gè)序列(包括EST，各種不同長度的基因片段)，Gene cluster就是將所有這些屬于同一個(gè)基因來源的片段歸類在一起，給出一個(gè)統(tǒng)一的基因編號，因此一個(gè)實(shí)際上就代表了某一個(gè)特定的基因。根據(jù)這個(gè)編號可以在GENEBANK中找到一個(gè)特定的基因。

3、過什么途徑查到基因的簡單功能。

我看到許多文獻(xiàn)上不同的名稱，如，Gene ID ,Genbank ID,下面是我檢索的一個(gè)頁面，您看時(shí)這樣的嗎?它的功能描述在哪里?

如果你要查找基因的簡單功能有兩種選擇，第一利用Gene ID 或 Genbank ID或基因名稱選擇NUCLEOTIDE進(jìn)入你現(xiàn)在看到的頁面，在右上角的LINK下你可以選擇LOCUS LINK一項(xiàng)，你就可以進(jìn)入相關(guān)的基因頁面（見附錄網(wǎng)頁）；或者直接用在首頁輸入基因名稱，選擇UNIGENE或LOCUS LINK項(xiàng)，你可以直接進(jìn)入LOCUS網(wǎng)頁，然后點(diǎn)擊LOCUS LINK就可以進(jìn)入你想要的基因的網(wǎng)頁，簡單的功能描述在這些網(wǎng)頁你都可以看到。

GenBank也可以和其他的序列分析軟件結(jié)合使用，從而對基因序列進(jìn)行比對分析。提交序列的時(shí)候只要將序列用sequin 編輯好即可以郵件形式發(fā)送給GENEBANK提供的郵箱即可。